1966年,电机工程系设有2个专业:电机与电器专业,发电厂电力网及电力系统专业。原工业企业电气化及自动化专业划入自动控制系。自动控制系设有工业企业电气化及自动化和自动控制两个专业(计划1966年招生,实际1973年组建)。动力工程系设有电厂热能动力装置、工业热能、水力机械和水电站动力装置四个专业。
1966年5月,“文化大革命”开始,开始“停课闹革命”。
1966年,1966届学生提前毕业,取消高考招生。
1966年,电机系杨庚文、马志云等与上海电机厂研制“同步电机单绕组”,3个样机(800KW电动机+400KW发电机)在江都泵站成功运行,用于解决淮河长江冬夏季发电排水问题。
1967年,接到上级指示,开始“复课闹革命”。
1968年,两届学生(1967届、1968届)毕业离校。
1969年,电机系教师下放到咸宁马桥镇劳动。
1970年,两届学生(1969届、1970届)毕业离校。
1970年,参加全国电机与电器专业设置的讨论。电机工程系原有电机设计与制造、电器设计与制造、工业企业电器化及自动化、发电厂电力网及输配电系统等4个专业,调整后包含2个专业:电机与电器、工业企业电气化及自动化。